本系以培育學生整合生物、機械、電機等工程知識，並應用到農業與食品、生物資源及醫療檢測等生物相關領域，期使學生在完成課業後，具有生物相關產業所需機電工程和系統整合的技術能力為宗旨。
1 ．生物生產自動化工程及生物生產機械之研發。 2 ．生物資源再利用下程之研發。 3 ．生物感測器與反應器之研發。 4 ．生物材料檢測及產品品質提昇技術之研發。
Direction
生物資源與工程苗志銘教師、李柏旻教師、吳瑋特教師 ============ 生物生產機械與控制蔡循恒教師、張仲良教師、陳韋誠教師、李經緯教師============ 生物感測與量測許益誠教師、陳志堅教師、李文宗教師、陳建興教師
Emphasis
生物產業機械化與自動化 生物光電感測應用之開發 生物環境控制工程 生物廢棄物再資源化工程 生質能源應用開發 生物晶片的應用開發